阿米巴经营的组织机构跟阿米巴变形虫较为相似。阿米巴变形虫最大的特性是能够随外界环境的变化而变化，不断地进行自我调整来适应所面临的生存环境。这种生物由于其极强的适应能力，在地球上存在了几十亿年，是地球上最古老，最具生命力和延续性的生物体。 

在阿米巴经营方式下，企业组织也可以随着外部环境变化而不断“变形”，调整到最佳状态，即能适应市场变化的灵活组织。阿米巴经营是把组织划分成一个个的小团体，通过独立核算制加以运作，在公司内部不断培养具备经营者意识的人才，实现全体员工共同参与经营的全员参与型经营。阿米巴经营主要目的：独立核算、培养人才、全员参与，其核心目的是帮助企业创造高利润。

凭借阿米巴经营，稻盛和夫使得京瓷企业集团历经现代史上4次经济危机而屹立不倒，成为全球企业界的神话，也是日本大企业中的唯一。KDDI、京瓷这两家稻盛和夫一手创办出来的企业集团在半个世纪中从未亏损，并先后进入世界500强。然而和道和结合中国企业的实际情况独创一套【心学X实学】阿米巴经营体系。

和道和【心学X实学】阿米巴经营体系：一、通过心学体系构建，统一企业经营哲学、价值观，打造企业可持续发展根基。二、通过组织划分，明确费用中心和利润中心的权责与目标，为年度目标实现打下夯实基础。三、通过把组织划小增强组织的灵活性，快速适应市场变化。四、通过内部交易独立核算把企业内部市场化，传递市场压力，加速内部成长。五、通过独立核算自主经营激发企业内部活力，培养人才经营意识与能力。六、通过实施阿米巴绩效评估与激励体系，实现组织人员价值最大化。和道和【心学X实学】阿米巴经营体系的目标是帮助企业实现降本增效，不断培养经营人才。